Iktikaf atau berdiam diri di masjid untuk mencari ridha Allah dan introspeksi diri biasa dilakukan umat muslim pada 10 hari terakhir Ramadan, sekaligus untuk menantikan malam Lailatul Qadar, malam isitimewa yang dinanti-nantikan semua umat muslim.
Edy menjelaskan jamaah bisa beriktiqaf di Masjid Namirah, "Kita fasilitasi bagi jamaah yang iktikaf secara gratis. Kita batasi 80-100 orang saja untuk ikhwan (laki-laki), untuk akhwat (perempuan) biasanya sampai 50 orang," katanya. Selain itu, para jamaah dapat pula mengikuti salat qiyamul lail berjamaah.
Masjid Namirah juga menyelenggarakan kajian ilmu setiap hari dengan ustad-ustad yang diundang dari luar kota Balikpapan. Kajian ilmu ini diadakan setiap selepas subuh, zuhur, dan isya selama bulan Ramadan.